Учреждение осуществляет свою деятельность на территории Российской Федерации, во внутренних морских водах, территориальном море, в исключительной экономической зоне и на континентальном шельфе Российской Федерации. За Учреждением закреплено имущество на праве оперативного управления в том числе, суда природоохранного назначения. Учредителем Учреждения является Российская Федерация.

Полномочия учредителя Учреждения от имени Российской Федерации осуществляет орган исполнительной власти – Федеральная служба по надзору в сфере природопользования (Росприроднадзор). Учреждение находится в непосредственном ведении Росприроднадзора в соответствии с распоряжением Правительства Российской Федерации от 31.12.2008 г. № 2056-р. Учреждение зарегистрировано за основным государственным регистрационным номером 1024101039380 как юридическое лицо, зарегистрированное до 01 июля 2002 года.

Территориальная сфера деятельности Учреждения в субъектах Российской Федерации определяется Росприроднадзором.С 2006 года и по настоящее время территориальная сфера деятельности Учреждения весьма обширна и включает, в том числе, морскую акваторию на Северо-Востоке России площадью 25 252 тыс. км2 (части Охотского и Берингова морей Тихого океана, Чукотского и Восточно-Сибирского морей Северного Ледовитого океана) и береговую полосу трех субъектов РФ (Камчатского края, Магаданской области и Чукотского автономного округа) общей протяженностью 13,2 тыс. км. Карта

Целями деятельности Учреждения являются техническое обеспечение осуществляемых Росприроднадзором контроля и надзора в установленной сфере деятельности во внутренних морских водах, территориальном море, на континентальном шельфе и в исключительной экономической зоне Российской Федерации, береговой линии в границах территории, примыкающей к морю, водоохранных зон морей, их прибрежных защитных полос, морских и речных портов и земельных участков прибрежных полос, занятых объектами хозяйственной и иной деятельности, являющихся водопользователями и/или оказывающих влияние на состояние морской среды, и в устьевых областях рек (устьевые участки рек с частью их бассейна и устьевым взморьем), а так же на федеральных внутренних водных путях.

Для достижения уставных целей Учреждение осуществляет для Росприроднадзора и его территориальных органов, осуществляющих контроль и надзор на море, в установленном законодательством Российской Федерации и Уставом порядке, за счет субсидий федерального бюджета и в соответствии с утвержденным государственным заданием, следующие основные виды деятельности (предмет деятельности Учреждения):

Экспертное сопровождение в рамках обеспечения федерального государственного экологического надзора;

Транспортное обеспечение федерального государственного экологического надзора на море.

Техническое обеспечение контрольно-надзорных мероприятий, осуществляемых отделами по надзору на море по Камчатскому краю, Чукотскому автономному округу и Магаданской области Тихоокеанского морского управления Федеральной службы по надзору в сфере природопользования (Росприроднадзора) проводится в соответствии с Регламентом взаимодействия при осуществлении контрольно-надзорных мероприятий в установленной сфере деятельности. Регламент разработан в целях повышения эффективности взаимодействия и координации деятельности Сторон в сфере федерального государственного экологического надзора, а также повышения эффективности исполнения установленных норм, правил и требований в области федерального государственного экологического надзора.